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課程資料下載

上課所需軟體,請學員事先下載:

【實作練習前期準備】請同學們在課前預先進行下列步驟:
1. 請在筆電上安裝MATLAB (2013b版本以上),確認可以開啟命令視窗(command window)。
2. 註冊後免費下載https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/SPM12。解壓縮後,在MATLAB中設置路徑(set path)指向SPM12資料夾 (包含底下所有子目錄,目錄名稱請避免以中文命名,否則無法正確開啟)。
3. 免費下載https://www.nitrc.org/frs/?group_id=279 CONN (version: 22.a)。解壓縮後,在MATLAB中設置路徑指向CONN資料夾(包含底下所有子目錄,目錄名稱請避免以中文命名,否則無法正確開啟)。
4. 下載範例檔案:https://drive.google.com/file/d/17BJVa6ud3dt0pD3LNZTcPH_dgz695L9L/view HandsOn_rsfMRI_CONN.zip (673MB)
5. 請先至CONN網頁,瀏覽Tutorials官方教學影片。https://web.conn-toolbox.org/tutorials


  *  實作課程請學員自備筆記型電腦,並務必先自行安裝matlab、SPM軟體及其他課程指定軟體 * 


軟體相關建議事項請參照下方說明:

課前請先灌好下列軟體: 1. Matlab:建議 2022a 以上 2. conn 22.a:課堂實作期間強烈建議使用該版本,以確保正常開啟講者已分析完畢的影像資料。 3. SPM 12

資料下載連結如下,下載後可依照下述資料存放概要,檢查是否在下載、或解壓縮的過程中資料缺漏: 1_Raw.zip(壓縮檔 673 MB → 解壓縮 1.93 GB): https://drive.google.com/file/d/1GeM7Yha_B0esvs7yLLjmB4sCNhlhh_4o/view?usp=sharing DataStructure.txt Stroke_Behav.csv Data 16個受試者資料夾,內皆存放下述三個資料 Resting_order.txt Resting_Pre.nii t1_Pre.nii 2_Denoising.zip(壓縮檔 30.15 GB → 解壓縮 57.95 GB): https://drive.google.com/file/d/1qafibctBF4y4XKyQLEnaFtooKxGaDsr8/view?usp=sharing Data:存放16位受試者前處理的資料夾,內皆存放54筆資料 Denoising.mat:CONN分析後自動生成的資料 Denoising.qlog: CONN分析後自動生成的資料夾,和內含3個資料夾,分別存放31筆資料 Denoising:CONN分析後自動生成的資料夾 bakfile.mat logfile.txt data BIDS:空資料夾 80個.mat檔 results bookmarks:空資料夾 firstlevel: SBC_01:2660個資料 methods:空資料夾 preprocessing:209個資料 qa:空資料夾 secondlevel:空資料夾 3_2ndLevelResult.zip(壓縮檔 30.29 GB → 解壓縮 58.71 GB): https://drive.google.com/file/d/1w4wiPNq5yLFisC1bPSJ_Wl7iB_x2pFKD/view?usp=share_link Data:存放16位受試者前處理的資料夾,內皆存放54筆資料 2ndLevelResult.mat 2ndLevelResult.qlog 240709104306363:45筆資料 240709115426552:45筆資料 240709120555879:45筆資料 240709122203213:31筆資料 240709130943843:31筆資料 240709131350743:31筆資料 2ndLevelResult bakfile.mat logfile.txt data BIDS:空資料夾 results bookmarks:空資料夾 firstlevel ALFF_01:19筆資料 ICC_01:19筆資料 IHC_01:19筆資料 LCOR_01:19筆資料 SBC_01:2660筆資料 GraphTheory:3筆資料 methods:空資料夾 preprocessing:209筆資料 qa:空資料夾 secondlevel ALFF_01 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest ALFF_6_1_1_64_1:21筆資料 ICC_01 Control(1).Stroke(-1) rest IntrinsicConnectivity_1_0_1_0_0_1_64_1:10筆資料 IHC_01 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest InterHemisphericCorrelation_8_0_1_64_1 21個資料 Cluster_Control-Stroke_xAge ROI:10筆資料 ROIanalysis:16筆資料 LCOR_01 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest LocalCorrelation_1_25_0_0_0_1_64_1:11筆資料 SBC_01 Control(1).Stroke(-1) rest:2筆資料 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest SensoriMotor.Lateral_l 14筆資料 SensoriMotor.Lateral_r 23筆資料 本連結經超過兩台不同電腦與網路測試,皆可下載。如若下載有狀況,請先更換不同瀏覽器。如以mac為例,若Chrome無法點擊下載,請嘗試Safari。

2024年【 fMRI教育講習課程 II 】歡迎報名參加




  • 課程時間: 2024年7月11日 星期四
  • 上課地點: 國立臺灣大學心理系北館N100演講廳(台北市羅斯福路四段1號)
  • 活動內容:


  • 講習對象:各領域的人文社會科學研究者及有興趣瞭解功能性磁振造影之各界人士。
           
  • 活動名額:報名後需經主辦單位審核,額滿為止。報名成功者於活動前一週以e-mail通知。
         未錄取者將不另行通知。不開放後補及現場報名,敬請及早報名!
  • 報名方式: 網路報名,額滿截止
  • 報名網址:

https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeUBlGap0o6enmBx4HRyuLkES_qZl2g5WZFAjcPn2pJZFmOwA/viewform?usp=sf_link

  • 主辦單位:
    國立台灣大學身體、心靈與文化整合影像研究中心
  • 協辦單位:
    國立臺灣大學心理系
    國立臺灣大學電機系
    科技部人工智慧生技醫療創新研究中心
  • 補助單位:國科會人文處
  • 聯絡洽詢:有任何疑問歡迎寄信至 ntuicibmcr@ntu.edu.tw

師資團隊

國防醫學院三軍總醫院龔怡嘉 助理教授
長庚大學許艾伶 教授
花蓮慈濟醫院 影像醫學吳虹誼 博士後研究員
news/20240605.1720572115.txt.gz · Last modified: 2024/07/10 08:41 by ntuicibmcr
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