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上課所需軟體,請學員事先下載:
【實作練習前期準備】請同學們在課前預先進行下列步驟:
1. 請在筆電上安裝MATLAB (2013b版本以上),確認可以開啟命令視窗(command window)。
2. 註冊後免費下載https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/SPM12。解壓縮後,在MATLAB中設置路徑(set path)指向SPM12資料夾 (包含底下所有子目錄,目錄名稱請避免以中文命名,否則無法正確開啟)。
3. 免費下載https://www.nitrc.org/frs/?group_id=279 CONN (version: 22.a)。解壓縮後,在MATLAB中設置路徑指向CONN資料夾(包含底下所有子目錄,目錄名稱請避免以中文命名,否則無法正確開啟)。
4. 下載範例檔案:https://drive.google.com/file/d/17BJVa6ud3dt0pD3LNZTcPH_dgz695L9L/view HandsOn_rsfMRI_CONN.zip (673MB)
5. 請先至CONN網頁,瀏覽Tutorials官方教學影片。https://web.conn-toolbox.org/tutorials
* 實作課程請學員自備筆記型電腦,並務必先自行安裝matlab、SPM軟體及其他課程指定軟體 *
軟體相關建議事項請參照下方說明:
課前請先灌好下列軟體: 1. Matlab:建議 2022a 以上 2. conn 22.a:課堂實作期間強烈建議使用該版本,以確保正常開啟講者已分析完畢的影像資料。 3. SPM 12
資料下載連結如下,下載後可依照下述資料存放概要,檢查是否在下載、或解壓縮的過程中資料缺漏: 1_Raw.zip(壓縮檔 673 MB → 解壓縮 1.93 GB): https://drive.google.com/file/d/1GeM7Yha_B0esvs7yLLjmB4sCNhlhh_4o/view?usp=sharing DataStructure.txt Stroke_Behav.csv Data 16個受試者資料夾,內皆存放下述三個資料 Resting_order.txt Resting_Pre.nii t1_Pre.nii 2_Denoising.zip(壓縮檔 30.15 GB → 解壓縮 57.95 GB): https://drive.google.com/file/d/1qafibctBF4y4XKyQLEnaFtooKxGaDsr8/view?usp=sharing Data:存放16位受試者前處理的資料夾,內皆存放54筆資料 Denoising.mat:CONN分析後自動生成的資料 Denoising.qlog: CONN分析後自動生成的資料夾,和內含3個資料夾,分別存放31筆資料 Denoising:CONN分析後自動生成的資料夾 bakfile.mat logfile.txt data BIDS:空資料夾 80個.mat檔 results bookmarks:空資料夾 firstlevel: SBC_01:2660個資料 methods:空資料夾 preprocessing:209個資料 qa:空資料夾 secondlevel:空資料夾 3_2ndLevelResult.zip(壓縮檔 30.29 GB → 解壓縮 58.71 GB): https://drive.google.com/file/d/1w4wiPNq5yLFisC1bPSJ_Wl7iB_x2pFKD/view?usp=share_link Data:存放16位受試者前處理的資料夾,內皆存放54筆資料 2ndLevelResult.mat 2ndLevelResult.qlog 240709104306363:45筆資料 240709115426552:45筆資料 240709120555879:45筆資料 240709122203213:31筆資料 240709130943843:31筆資料 240709131350743:31筆資料 2ndLevelResult bakfile.mat logfile.txt data BIDS:空資料夾 results bookmarks:空資料夾 firstlevel ALFF_01:19筆資料 ICC_01:19筆資料 IHC_01:19筆資料 LCOR_01:19筆資料 SBC_01:2660筆資料 GraphTheory:3筆資料 methods:空資料夾 preprocessing:209筆資料 qa:空資料夾 secondlevel ALFF_01 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest ALFF_6_1_1_64_1:21筆資料 ICC_01 Control(1).Stroke(-1) rest IntrinsicConnectivity_1_0_1_0_0_1_64_1:10筆資料 IHC_01 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest InterHemisphericCorrelation_8_0_1_64_1 21個資料 Cluster_Control-Stroke_xAge ROI:10筆資料 ROIanalysis:16筆資料 LCOR_01 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest LocalCorrelation_1_25_0_0_0_1_64_1:11筆資料 SBC_01 Control(1).Stroke(-1) rest:2筆資料 Control(1).Stroke(-1).Age(0) rest SensoriMotor.Lateral_l 14筆資料 SensoriMotor.Lateral_r 23筆資料 本連結經超過兩台不同電腦與網路測試,皆可下載。如若下載有狀況,請先更換不同瀏覽器。如以mac為例,若Chrome無法點擊下載,請嘗試Safari。
國防醫學院三軍總醫院 | 龔怡嘉 助理教授 |
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長庚大學 | 許艾伶 教授 |
花蓮慈濟醫院 影像醫學 | 吳虹誼 博士後研究員 |